根据新的“三定”方案，潮州市环保局职能基本保持不变，内设机构设置办公室、规划科、污染控制科、环境影响评价管理科、环境监察科（加挂环境监察分局牌子）共5个科室。行政编制17名，行政执法专项编制24名，机关后勤服务人员数4名。原市环境监察支队撤销，14名事业编制予以收回。

综合行政执法改革后，潮州市环保局科室总数减少1个，行政编制减少3名，行政执法专项编制数与原监察支队编制数比较增加10名。