根据《中共潮州市委、潮州市人民政府关于印发<潮州市人民政府机构改革方案>和<潮州市人民政府机构改革方案实施意见>的通知》（潮发[2009]19号），设立潮州市环境保护局，为市人民政府主管全市环境保护工作的工作部门，其主要职责是：

（一）贯彻执行国家和省关于环境保护的方针、政策、法律法规，起草本市环境保护管理办法、规定，并经批准后监督实施；拟订环境保护规划和计划；组织编制环境功能区划；审核城市总体规划中的环境保护内容。

（二）监督管理大气、水体、土壤、噪声、固体废物、有毒化学品以及机动车等污染的防治工作;负责辐射环境监督管理；调查处理重大污染事故和生态破坏事件；协调解决环境污染纠纷；负责环境监理和实施辖区内的环境保护综合行政执法。

（三）组织编制环境保护任期目标和任务，检查、指导、协调各县和有关行业环境保护责任目标；牵头实施全市污染减排目标、总量减排考核并公布考核结果，督查、督办、核查各县污染物减排任务的完成情况；组织实施本市城市环境综合整治及其定量考核工作。

（四）受市政府委托对重大经济和技术政策、发展规划以及重大经济开发计划组织环境影响评价；监督建设项目环境影响评价和“三同时”制度的实施；按管理权限审批环境影响评价文件。

（五）组织和监督排污总量控制、排污申报登记、排污许可证、污染限期治理、污染集中控制和达标排放等环境管理制度的实施。

（六）组织、检查、指导排污费的征收、管理和使用；会同有关部门管理市级环境保护专项资金。

（七）监督管理本市自然环境保护，统筹规划本市的自然保护区；监督对生态环境有影响的资源开发活动；指导、协调和监督全市农村生态环境保护、生态示范区建设。

（八）组织推广环境保护科学技术成果和技术示范工程；协助办理环保资质认可和环境管理体系、环境标志认证；指导和推动环保产业发展。

（九）负责环境监测、统计、信息管理工作；组织建设和管理本市环境监测网和信息网；组织编报环境质量报告书；发布环境状况公报。

（十）组织指导环境保护宣传教育工作，普及环境科学和法律知识；组织在职人员业务培训；指导中小学环境知识教育。

（十一）接待、受理环境保护方面的群众来信来访；承担有关行政处罚、行政复议、行政应诉工作；办理市人大、政协有关环境保护的建议、提案。

（十二）直接统一监督管理市区环境保护工作；对各县环境保护行政主管部门和行业的环境保护工作进行业务指导；归口管理环境保护项目利用外资工作；组织环境保护的对内对外交流与合作。

（十三）管理属下事业单位。

（十四）承办市委、市人民政府和上级主管部门交办的其他事项。